Cette partie du guide a été conçue pour aider les préleveurs à respecter nos préconisations pré-analytiques afin d'optimiser la qualité de nos résultats en bactériologie.

BUTS SELON LA NOMENCLATURE

Sont recherchées systématiquement les bactéries standards d’intérêt clinique. Les recherches particulières doivent faire l’objet d’une prescription explicite. Elles sont soumises à des dispositions pratiques particulières qui seront expliquées. L’antibiogramme est à l’appréciation du biologiste et n’est pas coté en supplément.

LIMITES TECHNIQUES

·       Prélever avant toute antibiothérapie. A défaut, le signaler avec le nom de l’antibiotique ou respecter une « fenêtre thérapeutique » de 3 jours.

·       Prélever plus que nécessaire, un échantillon biologique suffisamment enrichi (type écouvillon) doit être prélevé sinon le résultat peut être négatif par défaut.

·       Eviter les prélèvements sur écouvillon sec, les risques de dessiccation sont importants, préférer les milieux de transport ou les écouvillons en milieu humidifié.

·       Ne pas hésiter à demander au laboratoire des précisions sur le procédé à employer, le matériel ou tout autre renseignement pratique plutôt que de prélever au hasard. Par exemple, certains germes ne sont pas cultivables et leur diagnostic est seulement sérologique.

IDENTIFICATION OBLIGATOIRE

·       Nom, Prénom, Date de naissance, Date et Heure du prélèvement, Initiales du préleveur sur le prélèvement

·       Fiche de renseignements cliniques avec nature de l’échantillon

·       Prescription jointe

PRECAUTIONS UNIVERSELLES

·       Prélèvement réalisé avec du matériel stérile à usage unique et adapté au type de prélèvement

·       Port de gants recommandé

·       Elimination du matériel nécessaire au prélèvement suivant  les consignes préétablies au sein des établissements de santé ou selon celles du préleveur.

TRANSPORT ET CONSERVATION

·       Conservation transitoire à 4°C possible pour certains prélèvements (cf. fiche correspondante)

·       Délai d’acheminement vers le laboratoire le plus court possible

·       Milieux de transport parfois obligatoires (cf. fiche de chaque prélèvement)

DELAI DE REALISATION

Ils sont très variables en fonction des prélèvements, des bactéries recherchées et de la positivité des cultures selon les germes nécessitant une identification et/ou un antibiogramme.

Délais maximum : J5 pour des prélèvements classiques, J11 pour des hémocultures, J14 pour les prélèvements profonds et anaérobies, J45 pour des prélèvements mycologiques, J60 pour des cultures de mycobactéries.

METHODES UTILISEES

A LaBio16, les recherches standard des bactéries d’intérêt clinique sont faites en suivant des méthodes conventionnelles d’analyse selon les référentiels habituels (ex : REMIC, Ed 2010).

·       Les examens directs sont faits par méthode manuelle (microscope) ou méthode automatisée (IRIS en cytologie urinaire) après coloration manuelle standardisée ou automatisée (Aerospray Elitech, Hematek Siemens)

·       Les méthodes de culture sont conventionnelles et  adaptées au prélèvement et aux bactéries recherchées sur des  milieux gélosés (Biomérieux), en milieu liquide (Biomérieux, Oxoid) ou en galerie (Elitech)

·       L’identification des bactéries d’intérêt clinique se fait par méthode automatisée (Vitek Biomérieux) ou tests spécifiques manuels (BioRad, J2L, Biomérieux).

·       Les antibiogrammes des bactéries pathogènes se font par méthode automatisée en milieu liquide (Vitek Biomérieux) ou sur milieu gélosé (BioRad, Biomérieux, Oxoid)

·       Des systèmes informatiques d’expertise (Vitek Biomérieux, Osiris BioRad) aident à la validation des résultats.

Sauf pour quelques cas particuliers, tous les prélèvements bactériologiques peuvent être faits au laboratoire de préférence sur Rendez vous.